Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms