Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD247P20963 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD247P20963 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD247P20963 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CD247P20963 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD247P20963 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD247P20963 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD247P20963 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD247P20963 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD247P20963 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD247P20963 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD247P20963 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD247P20963 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD247P20963 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD247P20963 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD247P20963 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD247P20963 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD247P20963 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD247P20963 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD247P20963 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD247P20963 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD247P20963 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD247P20963 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD247P20963 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD247P20963 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD247P20963 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD247P20963 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD247P20963 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD247P20963 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD247P20963 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD247P20963 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD247P20963 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD247P20963 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD247P20963 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD247P20963 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD247P20963 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CD247P20963 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD247P20963 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD247P20963 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD247P20963 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD247P20963 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD247P20963 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD247P20963 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD247P20963 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD247P20963 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD247P20963 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD247P20963 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD247P20963 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD247P20963 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD247P20963 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD247P20963 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD247P20963 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD247P20963 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD247P20963 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD247P20963 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD247P20963 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD247P20963 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD247P20963 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD247P20963 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD247P20963 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD247P20963 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD247P20963 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD247P20963 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD247P20963 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD247P20963 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD247P20963 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD247P20963 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CD247P20963 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CD247P20963 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD247P20963 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CD247P20963 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD247P20963 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD247P20963 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CD247P20963 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CD247P20963 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD247P20963 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD247P20963 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD247P20963 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD247P20963 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD247P20963 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD247P20963 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD247P20963 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD247P20963 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD247P20963 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD247P20963 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CD247P20963 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD247P20963 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD247P20963 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD247P20963 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD247P20963 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD247P20963 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD247P20963 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD247P20963 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD247P20963 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD247P20963 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD247P20963 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD247P20963 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD247P20963 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD247P20963 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD247P20963 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms