Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms