Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF3P18847 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF3P18847 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF3P18847 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF3P18847 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF3P18847 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF3P18847 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF3P18847 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF3P18847 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF3P18847 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF3P18847 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF3P18847 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF3P18847 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF3P18847 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF3P18847 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF3P18847 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF3P18847 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF3P18847 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF3P18847 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF3P18847 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF3P18847 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF3P18847 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF3P18847 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF3P18847 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF3P18847 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF3P18847 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF3P18847 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF3P18847 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF3P18847 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF3P18847 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF3P18847 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF3P18847 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF3P18847 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF3P18847 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF3P18847 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF3P18847 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF3P18847 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF3P18847 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF3P18847 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF3P18847 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF3P18847 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF3P18847 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF3P18847 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF3P18847 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF3P18847 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF3P18847 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF3P18847 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF3P18847 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF3P18847 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF3P18847 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF3P18847 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF3P18847 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF3P18847 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF3P18847 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF3P18847 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF3P18847 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF3P18847 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF3P18847 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF3P18847 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF3P18847 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF3P18847 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF3P18847 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF3P18847 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF3P18847 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF3P18847 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF3P18847 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF3P18847 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF3P18847 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF3P18847 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF3P18847 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF3P18847 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF3P18847 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF3P18847 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF3P18847 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF3P18847 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF3P18847 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF3P18847 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF3P18847 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF3P18847 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF3P18847 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF3P18847 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF3P18847 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF3P18847 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF3P18847 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF3P18847 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF3P18847 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF3P18847 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF3P18847 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF3P18847 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF3P18847 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF3P18847 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF3P18847 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF3P18847 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF3P18847 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF3P18847 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF3P18847 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF3P18847 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF3P18847 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF3P18847 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF3P18847 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms