Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOP2AP11388 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms