Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPBP07199 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPBP07199 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPBP07199 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPBP07199 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPBP07199 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPBP07199 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPBP07199 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPBP07199 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPBP07199 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPBP07199 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPBP07199 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPBP07199 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPBP07199 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPBP07199 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPBP07199 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPBP07199 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPBP07199 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPBP07199 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPBP07199 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPBP07199 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPBP07199 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPBP07199 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPBP07199 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPBP07199 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPBP07199 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPBP07199 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPBP07199 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPBP07199 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPBP07199 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPBP07199 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPBP07199 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPBP07199 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPBP07199 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPBP07199 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPBP07199 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPBP07199 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPBP07199 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPBP07199 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPBP07199 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPBP07199 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPBP07199 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPBP07199 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPBP07199 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPBP07199 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPBP07199 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPBP07199 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPBP07199 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPBP07199 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPBP07199 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPBP07199 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPBP07199 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPBP07199 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPBP07199 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPBP07199 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPBP07199 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPBP07199 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPBP07199 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPBP07199 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPBP07199 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPBP07199 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPBP07199 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPBP07199 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPBP07199 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPBP07199 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPBP07199 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPBP07199 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPBP07199 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPBP07199 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPBP07199 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPBP07199 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPBP07199 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPBP07199 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPBP07199 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPBP07199 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPBP07199 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPBP07199 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPBP07199 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPBP07199 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPBP07199 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPBP07199 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPBP07199 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPBP07199 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPBP07199 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPBP07199 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPBP07199 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPBP07199 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPBP07199 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPBP07199 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPBP07199 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPBP07199 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPBP07199 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPBP07199 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPBP07199 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPBP07199 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPBP07199 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPBP07199 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPBP07199 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPBP07199 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPBP07199 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms