Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms