Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.3 ms