Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms