Protein–RNA interactions for Protein: Q99674

CGREF1, Cell growth regulator with EF hand domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGREF1Q99674 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms