Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms