Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDCL2Q8N4E4 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDCL2Q8N4E4 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDCL2Q8N4E4 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDCL2Q8N4E4 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDCL2Q8N4E4 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDCL2Q8N4E4 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDCL2Q8N4E4 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDCL2Q8N4E4 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCL2Q8N4E4 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCL2Q8N4E4 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCL2Q8N4E4 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCL2Q8N4E4 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCL2Q8N4E4 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCL2Q8N4E4 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCL2Q8N4E4 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCL2Q8N4E4 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCL2Q8N4E4 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCL2Q8N4E4 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCL2Q8N4E4 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCL2Q8N4E4 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCL2Q8N4E4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCL2Q8N4E4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCL2Q8N4E4 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCL2Q8N4E4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCL2Q8N4E4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCL2Q8N4E4 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCL2Q8N4E4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCL2Q8N4E4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCL2Q8N4E4 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCL2Q8N4E4 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCL2Q8N4E4 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCL2Q8N4E4 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCL2Q8N4E4 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCL2Q8N4E4 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCL2Q8N4E4 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCL2Q8N4E4 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms