Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM48Q8IWZ4 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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