Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms