Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 350.4 ms