Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms