Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRIM16LQ309B1 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms