Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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RTL8BQ17RB0 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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RTL8BQ17RB0 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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RTL8BQ17RB0 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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RTL8BQ17RB0 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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