Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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