Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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CNGA3Q16281 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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CNGA3Q16281 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNGA3Q16281 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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