Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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NCF4Q15080 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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