Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM25Q14258 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms