Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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