Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DNASE1L3Q13609 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms