Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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ITGB3BPQ13352 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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ITGB3BPQ13352 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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ITGB3BPQ13352 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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ITGB3BPQ13352 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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ITGB3BPQ13352 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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ITGB3BPQ13352 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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