Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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SRSF6Q13247 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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SRSF6Q13247 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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SRSF6Q13247 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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SRSF6Q13247 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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