Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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BNIP1Q12981 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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BNIP1Q12981 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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BNIP1Q12981 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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BNIP1Q12981 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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BNIP1Q12981 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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BNIP1Q12981 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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BNIP1Q12981 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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BNIP1Q12981 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms