Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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H3F3AP84243 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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H3F3AP84243 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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H3F3AP84243 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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H3F3AP84243 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
H3F3AP84243 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
H3F3AP84243 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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