Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMF1P82094 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMF1P82094 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMF1P82094 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMF1P82094 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMF1P82094 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMF1P82094 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMF1P82094 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMF1P82094 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMF1P82094 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMF1P82094 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMF1P82094 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMF1P82094 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMF1P82094 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMF1P82094 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMF1P82094 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMF1P82094 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TMF1P82094 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TMF1P82094 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMF1P82094 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMF1P82094 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMF1P82094 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMF1P82094 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMF1P82094 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMF1P82094 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMF1P82094 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMF1P82094 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMF1P82094 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMF1P82094 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMF1P82094 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMF1P82094 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMF1P82094 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMF1P82094 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMF1P82094 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMF1P82094 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TMF1P82094 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMF1P82094 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMF1P82094 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMF1P82094 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMF1P82094 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMF1P82094 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TMF1P82094 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMF1P82094 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMF1P82094 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMF1P82094 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMF1P82094 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMF1P82094 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMF1P82094 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMF1P82094 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMF1P82094 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TMF1P82094 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMF1P82094 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMF1P82094 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMF1P82094 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TMF1P82094 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMF1P82094 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMF1P82094 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMF1P82094 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMF1P82094 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMF1P82094 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMF1P82094 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMF1P82094 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMF1P82094 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMF1P82094 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMF1P82094 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMF1P82094 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TMF1P82094 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMF1P82094 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMF1P82094 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMF1P82094 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMF1P82094 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMF1P82094 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMF1P82094 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMF1P82094 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMF1P82094 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMF1P82094 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMF1P82094 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMF1P82094 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMF1P82094 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMF1P82094 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMF1P82094 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMF1P82094 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMF1P82094 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMF1P82094 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMF1P82094 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMF1P82094 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMF1P82094 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMF1P82094 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMF1P82094 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMF1P82094 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMF1P82094 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMF1P82094 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMF1P82094 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMF1P82094 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMF1P82094 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMF1P82094 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMF1P82094 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMF1P82094 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMF1P82094 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMF1P82094 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms