Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UFM1P61960 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UFM1P61960 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UFM1P61960 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UFM1P61960 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UFM1P61960 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UFM1P61960 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFM1P61960 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFM1P61960 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFM1P61960 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFM1P61960 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFM1P61960 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFM1P61960 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFM1P61960 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFM1P61960 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFM1P61960 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UFM1P61960 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFM1P61960 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFM1P61960 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFM1P61960 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UFM1P61960 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFM1P61960 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFM1P61960 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFM1P61960 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFM1P61960 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFM1P61960 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFM1P61960 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFM1P61960 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFM1P61960 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFM1P61960 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFM1P61960 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFM1P61960 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFM1P61960 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFM1P61960 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFM1P61960 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UFM1P61960 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFM1P61960 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFM1P61960 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFM1P61960 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFM1P61960 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFM1P61960 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UFM1P61960 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UFM1P61960 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UFM1P61960 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UFM1P61960 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UFM1P61960 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UFM1P61960 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UFM1P61960 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UFM1P61960 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UFM1P61960 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UFM1P61960 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UFM1P61960 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UFM1P61960 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UFM1P61960 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UFM1P61960 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UFM1P61960 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UFM1P61960 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UFM1P61960 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UFM1P61960 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UFM1P61960 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UFM1P61960 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UFM1P61960 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UFM1P61960 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UFM1P61960 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UFM1P61960 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UFM1P61960 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UFM1P61960 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UFM1P61960 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UFM1P61960 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UFM1P61960 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UFM1P61960 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UFM1P61960 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UFM1P61960 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UFM1P61960 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UFM1P61960 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UFM1P61960 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UFM1P61960 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UFM1P61960 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UFM1P61960 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UFM1P61960 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UFM1P61960 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UFM1P61960 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UFM1P61960 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UFM1P61960 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UFM1P61960 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UFM1P61960 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UFM1P61960 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UFM1P61960 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UFM1P61960 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UFM1P61960 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UFM1P61960 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UFM1P61960 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UFM1P61960 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UFM1P61960 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UFM1P61960 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UFM1P61960 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UFM1P61960 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UFM1P61960 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UFM1P61960 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UFM1P61960 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms