Protein–RNA interactions for Protein: P61158

ACTR3, Actin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3P61158 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR3P61158 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms