Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms