Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP107P57740 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP107P57740 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP107P57740 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP107P57740 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP107P57740 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP107P57740 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP107P57740 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP107P57740 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP107P57740 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP107P57740 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP107P57740 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP107P57740 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP107P57740 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP107P57740 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP107P57740 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP107P57740 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP107P57740 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP107P57740 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP107P57740 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP107P57740 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP107P57740 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP107P57740 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP107P57740 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP107P57740 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP107P57740 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP107P57740 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP107P57740 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP107P57740 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP107P57740 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP107P57740 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP107P57740 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP107P57740 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP107P57740 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP107P57740 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP107P57740 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP107P57740 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP107P57740 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP107P57740 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP107P57740 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP107P57740 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP107P57740 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP107P57740 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP107P57740 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP107P57740 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP107P57740 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP107P57740 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP107P57740 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP107P57740 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP107P57740 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP107P57740 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP107P57740 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP107P57740 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP107P57740 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP107P57740 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP107P57740 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP107P57740 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP107P57740 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP107P57740 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP107P57740 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP107P57740 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP107P57740 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP107P57740 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP107P57740 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP107P57740 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP107P57740 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP107P57740 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP107P57740 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP107P57740 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP107P57740 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP107P57740 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP107P57740 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP107P57740 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP107P57740 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP107P57740 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP107P57740 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP107P57740 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP107P57740 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP107P57740 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP107P57740 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP107P57740 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP107P57740 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP107P57740 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP107P57740 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP107P57740 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP107P57740 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP107P57740 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP107P57740 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP107P57740 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP107P57740 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP107P57740 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP107P57740 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP107P57740 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP107P57740 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP107P57740 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP107P57740 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP107P57740 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP107P57740 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP107P57740 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP107P57740 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms