Protein–RNA interactions for Protein: P56282

POLE2, DNA polymerase epsilon subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE2P56282 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLE2P56282 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLE2P56282 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
POLE2P56282 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLE2P56282 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLE2P56282 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLE2P56282 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLE2P56282 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
POLE2P56282 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLE2P56282 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLE2P56282 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLE2P56282 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLE2P56282 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLE2P56282 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLE2P56282 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLE2P56282 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLE2P56282 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLE2P56282 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLE2P56282 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLE2P56282 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLE2P56282 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLE2P56282 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLE2P56282 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLE2P56282 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLE2P56282 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLE2P56282 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLE2P56282 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLE2P56282 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLE2P56282 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLE2P56282 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLE2P56282 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLE2P56282 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLE2P56282 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLE2P56282 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLE2P56282 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLE2P56282 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLE2P56282 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLE2P56282 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
POLE2P56282 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLE2P56282 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLE2P56282 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
POLE2P56282 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLE2P56282 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLE2P56282 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLE2P56282 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLE2P56282 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLE2P56282 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLE2P56282 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLE2P56282 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLE2P56282 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLE2P56282 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLE2P56282 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLE2P56282 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLE2P56282 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
POLE2P56282 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLE2P56282 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLE2P56282 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLE2P56282 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLE2P56282 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLE2P56282 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLE2P56282 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLE2P56282 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLE2P56282 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLE2P56282 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLE2P56282 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLE2P56282 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLE2P56282 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLE2P56282 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
POLE2P56282 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLE2P56282 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLE2P56282 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLE2P56282 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLE2P56282 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLE2P56282 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLE2P56282 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLE2P56282 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLE2P56282 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLE2P56282 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLE2P56282 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLE2P56282 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLE2P56282 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLE2P56282 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLE2P56282 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLE2P56282 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLE2P56282 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLE2P56282 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLE2P56282 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLE2P56282 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLE2P56282 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLE2P56282 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLE2P56282 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
POLE2P56282 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLE2P56282 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLE2P56282 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
POLE2P56282 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLE2P56282 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLE2P56282 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLE2P56282 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLE2P56282 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLE2P56282 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms