Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms