Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GJA4P35212 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GJA4P35212 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GJA4P35212 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GJA4P35212 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GJA4P35212 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GJA4P35212 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GJA4P35212 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GJA4P35212 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GJA4P35212 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GJA4P35212 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GJA4P35212 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GJA4P35212 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GJA4P35212 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GJA4P35212 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GJA4P35212 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GJA4P35212 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GJA4P35212 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GJA4P35212 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GJA4P35212 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GJA4P35212 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GJA4P35212 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GJA4P35212 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GJA4P35212 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GJA4P35212 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GJA4P35212 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GJA4P35212 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GJA4P35212 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GJA4P35212 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GJA4P35212 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GJA4P35212 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GJA4P35212 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GJA4P35212 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GJA4P35212 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GJA4P35212 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GJA4P35212 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GJA4P35212 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GJA4P35212 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GJA4P35212 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GJA4P35212 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GJA4P35212 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GJA4P35212 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GJA4P35212 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA4P35212 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA4P35212 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA4P35212 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA4P35212 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA4P35212 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA4P35212 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA4P35212 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA4P35212 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA4P35212 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA4P35212 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA4P35212 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA4P35212 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA4P35212 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA4P35212 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA4P35212 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA4P35212 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA4P35212 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA4P35212 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA4P35212 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA4P35212 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA4P35212 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA4P35212 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA4P35212 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA4P35212 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA4P35212 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA4P35212 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA4P35212 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA4P35212 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA4P35212 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA4P35212 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA4P35212 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA4P35212 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA4P35212 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA4P35212 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA4P35212 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA4P35212 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA4P35212 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA4P35212 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA4P35212 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA4P35212 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA4P35212 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA4P35212 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA4P35212 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA4P35212 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA4P35212 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA4P35212 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA4P35212 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA4P35212 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA4P35212 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA4P35212 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA4P35212 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA4P35212 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA4P35212 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA4P35212 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA4P35212 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA4P35212 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA4P35212 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms