Protein–RNA interactions for Protein: P21291

CSRP1, Cysteine and glycine-rich protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP1P21291 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSRP1P21291 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms