Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms