Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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PDE6GP18545 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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PDE6GP18545 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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PDE6GP18545 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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PDE6GP18545 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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PDE6GP18545 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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PDE6GP18545 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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PDE6GP18545 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
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PDE6GP18545 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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PDE6GP18545 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PDE6GP18545 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PDE6GP18545 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PDE6GP18545 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PDE6GP18545 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PDE6GP18545 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PDE6GP18545 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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