Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEFLP07196 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEFLP07196 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEFLP07196 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NEFLP07196 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEFLP07196 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEFLP07196 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEFLP07196 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEFLP07196 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEFLP07196 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFLP07196 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFLP07196 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFLP07196 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFLP07196 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFLP07196 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFLP07196 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFLP07196 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFLP07196 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFLP07196 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFLP07196 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFLP07196 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFLP07196 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFLP07196 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFLP07196 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFLP07196 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFLP07196 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFLP07196 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFLP07196 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFLP07196 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFLP07196 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFLP07196 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFLP07196 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFLP07196 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFLP07196 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFLP07196 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFLP07196 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFLP07196 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFLP07196 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFLP07196 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFLP07196 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFLP07196 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFLP07196 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFLP07196 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFLP07196 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFLP07196 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFLP07196 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFLP07196 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFLP07196 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFLP07196 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFLP07196 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFLP07196 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFLP07196 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEFLP07196 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEFLP07196 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEFLP07196 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEFLP07196 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEFLP07196 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEFLP07196 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEFLP07196 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEFLP07196 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEFLP07196 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEFLP07196 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NEFLP07196 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEFLP07196 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEFLP07196 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEFLP07196 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEFLP07196 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEFLP07196 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEFLP07196 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEFLP07196 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEFLP07196 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEFLP07196 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEFLP07196 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEFLP07196 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEFLP07196 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEFLP07196 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEFLP07196 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEFLP07196 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEFLP07196 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEFLP07196 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEFLP07196 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEFLP07196 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEFLP07196 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEFLP07196 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NEFLP07196 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEFLP07196 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEFLP07196 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEFLP07196 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEFLP07196 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEFLP07196 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEFLP07196 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEFLP07196 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEFLP07196 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEFLP07196 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NEFLP07196 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEFLP07196 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEFLP07196 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEFLP07196 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEFLP07196 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEFLP07196 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms