Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms