Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms