Protein–RNA interactions for Protein: H3BSU7

TMX2-CTNND1, TMX2-CTNND1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX2-CTNND1H3BSU7 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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