Protein–RNA interactions for Protein: E5RI56

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E5RI56 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E5RI56 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E5RI56 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E5RI56 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E5RI56 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E5RI56 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E5RI56 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E5RI56 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E5RI56 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E5RI56 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E5RI56 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E5RI56 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E5RI56 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E5RI56 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
E5RI56 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E5RI56 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E5RI56 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E5RI56 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E5RI56 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E5RI56 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E5RI56 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E5RI56 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E5RI56 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E5RI56 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E5RI56 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E5RI56 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E5RI56 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E5RI56 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
E5RI56 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E5RI56 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E5RI56 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E5RI56 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E5RI56 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E5RI56 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
E5RI56 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E5RI56 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E5RI56 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E5RI56 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E5RI56 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E5RI56 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E5RI56 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E5RI56 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E5RI56 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E5RI56 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E5RI56 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E5RI56 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E5RI56 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E5RI56 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E5RI56 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E5RI56 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E5RI56 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E5RI56 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E5RI56 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E5RI56 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E5RI56 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E5RI56 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
E5RI56 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E5RI56 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E5RI56 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E5RI56 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E5RI56 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E5RI56 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
E5RI56 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E5RI56 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E5RI56 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E5RI56 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E5RI56 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E5RI56 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E5RI56 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
E5RI56 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
E5RI56 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
E5RI56 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
E5RI56 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
E5RI56 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E5RI56 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E5RI56 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E5RI56 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
E5RI56 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E5RI56 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
E5RI56 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E5RI56 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E5RI56 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E5RI56 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E5RI56 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E5RI56 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
E5RI56 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E5RI56 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E5RI56 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E5RI56 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E5RI56 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
E5RI56 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E5RI56 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E5RI56 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E5RI56 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E5RI56 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E5RI56 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E5RI56 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E5RI56 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E5RI56 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E5RI56 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms