Protein–RNA interactions for Protein: C9J3I9

C5orf58, Putative uncharacterized protein C5orf58, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf58C9J3I9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C5orf58C9J3I9 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms