Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms