Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYH9

UTP6, U3 small nucleolar RNA-associated protein 6 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP6Q9NYH9 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UTP6Q9NYH9 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms