Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSU72Q9NP77 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms