Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms