Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYU5

KRTAP2-1, Keratin-associated protein 2-1, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-1Q9BYU5 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 SIGLEC20P-201ENST00000595243 1311 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP2-1Q9BYU5 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms